บุคลากรสาขาเคมีเชิงฟิสิกส์
รศ.ดร. ประภาศิริ พงษ์ประยูร
Prapasiri Pongprayoon
Associate Professor
Chemistry Building 313 | |
Research Highlights
งานวิจัยด้านเคมีคอมพิวเตอร์ โดยมุ่งเน้นการตอบโจทย์ด้านการแพทย์และการเกษตรและอาหาร
⊙ DPhil (Biochemistry), University of Oxford, UK
⊙ MRes (Bioinformatics) University of Leeds, UK
⊙ M.Sc. (Physical Chemistry) Kasetsart U.
⊙ B.Sc. (Chemistry) Kasetsart U.
งานวิจัยด้านเคมีคอมพิวเตอร์ โดยมุ่งเน้นการตอบโจทย์ด้านการแพทย์และการเกษตรและอาหาร
งานวิจัยด้านการแพทย์
- การพัฒนาชุดตรวจทางการแพทย์ (เช่น แอปตาเซนเซอร์ นาโนพอร์เซนเซอร์สำหรับเบาหวาน โรคไต หรือ มะเร็ง) ร่วมกับหน่วยงานภายนอก
- การศึกษากลไกการทำงานของสารชีวโมเลกุลที่สำคัญต่อการเกิดโรคต่างๆ เช่น มะเร็งและเบาหวาน เพื่อการพัฒนายาที่มีประสิทธิภาพ
ความร่วมมือกับหน่วยงานภายนอก: นาโนเทค คณะแพทย์ศาสตร์ รพ.ศิริราช เป็นต้น
งานวิจัยด้านการเกษตร
- การทำความเข้าใจกลไกการทำงานของโปรตีนที่สำคัญต่อการพัฒนาคุณภาพอาหารจากพืชและสัตว์เศรษฐกิจ เช่น การพัฒนาและรักษาคุณค่าทางอาหารของเนื้อสัตว์และพืชผัก โดยร่วมมือกับคณะเกษตรศาสตร์ ม.เกษตรศาสตร์
ความร่วมมือกับหน่วยงานภายนอก: คณะเกษตรศาสตร์ คณะเทคนิคสัตว์แพทย์ มก.
หากต้องการข้อมูลเพิ่มเติมสามารถติดต่อได้ทาง อีเมล
หากต้องการทุนการศึกษา สามารถติดต่อเพื่อคุยรายละเอียดในเบื้องต้นได้
1) Pongprayoon P, Beckstein O, Wee CL, and Sansom MSP*. Simulations of anion transport through OprP reveal the molecular basis for high affinity and selectivity for phosphate, PNAS. 2009, 106:21614-21618.
2) Pongprayoon P, Beckstein O, and Sansom MSP*. Biomimetic design of a brush-like nanopore: Simulation studies, J Phys Chem B, 2012, 116:462-468.
3) Pongprayoon P*. How do the protonation states of E296 and D312 in OmpF and D299 and D315 in homologous OmpC affect protein structure and dynamics? Simulation studies, Comp Bio Chem, 2014, 53:226-234.
4) Pongprayoon P and Gleeson MP*. Probing the Binding Site Characteristics of Human Serum Albumin: A Combined Molecular Dynamics and Cheminformatics Investigation, J Mol Graph Model, 2014, 54:164-173
5) Niramitranon J, Sansom MSP, and Pongprayoon P*. Why do the outer membrane proteins OmpF from E.coli and OprP from P.aeruginosa prefer trimers? Simulation studies, J Mol Graph Model, 2016, 10:1-7
6) Chayachon A, Luksirikul P, Kankla P. Pongprayoon P, Tarattrakoon, K, Paiboonsukwong K, Fuchareon, S, Dharakul T, and Japrung D*. Graphene based Aptasensor for Glycated Albumin in Diabetes Mellitus Diagnosis and Monitoring, Biosens Bioelectron, 2016, 82:140-145.
7) Awang T, Wiriyatanakorn, N, Saparpakorn P, Japrung D, and Pongprayoon P*, Understanding the effects of two bound glucose in Sudlow site I on structure and function of human serum albumin: Theoretical studies, J Bio Struc Dyn, 2017, 35: 781-790.
8) Panman W, Japrung D, and Pongprayoon P*, Exploring the interactions of aptamer with human serum albumin: Simulation studies, J Bio Struc Dyn, 2017, 35:2328-2336.
9) Somboon K, Niramitranon J, and Pongprayoon P*, Probing binding affinities of impenem and ertapenem with outer membrane carboxylate channel D1 (OccD1) from P. aeruginosa: Simulation studies, J Mol Model, 2017, 23(8).
10) Pongprayoon P*, Mori T, The critical role of dimer formation in monosaccharides binding to Human Serum Albumin, PCCP, 2018, 20:3249-3257.
11) Chaimanatsakun A, Japrung D, and Pongprayoon P*, Multiscale simulation studies of geometrical effects on solution transport through nanopores, Mol Simul, 2018, 44:12-20.
12) Baicharoen A, Vijayan R, and Pongprayoon P*, Structural insights into betaine aldehyde dehydrogenase (BADH2) from oryza sative explored by modeling and simulations, Sci Rep, 2018. 8:12892.
13) Pongprayoon P and Chaimanatsakun A, Revealing the effects of pore sizes and geometries on mechanical properties of graphene nanopore using atomistic finite element method, Acta Mec Solida Sin, 2018.
14) Awang T and Pongprayoon P*, The adsorption of human defensin 5 on bacterial membranes: simulation studies, J Mol Model, 2018, 24:273.
15) Awang T, Thangsan P, Luksirikul P, Japrung D, and Pongprayoon P* “The adsorption of glycated human serum albumin-selective aptamer onto a graphene sheet: simulation studies, Mol Sim, 2019, 45: 841-848.
16) Chairatana P, Niramitranon J and Pongprayoon P* ”Dynamics of human defensin 5 (HD5) self-assembly in solution: Molecular simulations/insights”. Comp Biol Chem. 2019, 83: 107091
17) Pongprayoon P, Niramitanon J, Kaewhom P, Kaewmongkol S, Suwan E, Sitch RW, and Jittapalapong S* “Dynamic and structural insights into tick serpin from Ixodes Ricinus” J Bio Struc Dyn. 2019, 8: 1-8.
18) Niramitranon J and Pongprayoon P*. Exploring the binding modes of cordycepin to human adenosine deaminase 1 (ADA1) compared to adenosine and 2’-deoxyadenosine, J Mol Model, 2020, 2:29.
19) Ketrat, S, Japrung D, and Pongprayoon P*. Exploring how structural and dynamic properties of bovine and canine serum albumins differ from human serum albumin, J Mol Grap Mod, 2020, :107601.
20) Chawjiraphan W, Apiwat C, Segkhonthod K, Treerattrakoon K, Pinpradup P, Pongprayoon P, Luksirikul P, Japrung D*. Sensitive detection of albuminuria by graphene oxide-mediated fluorescence quenching aptasensor, Spec Acta Part A, 2020, 231:118128.